정부 지원 해외파견을 나가고 나중에 waive 하고 전환하기??

제가 현재 석사졸업생 신분으로 정부 지원 해외파견을 나가 해외 대학 어느 연구실에서 내년 1월부터 (정부 장학금을 받으며) 연구를 할 예정입니다.
그런데 이것은 나중에 한국에 다시 돌아와야 하는 J1 비자로 해외에 나가는 것이기 때문에
해당 대학 연구실의 교수님께서 내년 9월부터는 박사과정 학생으로 입학하여 F1 비자로 전환하기를 원하고 계십니다.
그러시면서 이런 경우 그 때 이 정부 지원 해외파견 사업 측에 "waive"를 해야한다고 말씀하시더라고요.
흠... 이게 정말 그렇게 가능한 걸까요? 해당 사업 측에 갑자기 해외파견 활동 중간에 포기를 하겠다고 전달하면 지원금 전액 배상하게 되거나, 정부 측에서 J1 비자 만료되면 반드시 한국에 돌아오는 걸 댓가로 지원해준 건데 맘대로 그렇게 전환할 수 없다던지, 뭔가 복잡한 문제가 생길까봐 걱정이 되네요...
혹시 이런 비슷한 경우를 보신 분 계시나요?